Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlcd1Q99JT6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms