Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ddb2Q99J79 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ddb2Q99J79 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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