Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms