Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrm1Q99J25 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms