Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spdl1Q923A2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spdl1Q923A2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms