Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Clip1Q922J3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clip1Q922J3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Clip1Q922J3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms