Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b3Q921M3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms