Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TardbpQ921F2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TardbpQ921F2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TardbpQ921F2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms