Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Afg3l1Q920A7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Afg3l1Q920A7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1Q920A7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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