Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpe65Q91ZQ5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms