Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Pde6cQ91ZQ1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Pde6cQ91ZQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Pde6cQ91ZQ1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Pde6cQ91ZQ1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Pde6cQ91ZQ1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pde6cQ91ZQ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Pde6cQ91ZQ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Pde6cQ91ZQ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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