Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc49Q91YK0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc49Q91YK0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms