Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm2Q91YD4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms