Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhga12Q91XY7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhga12Q91XY7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms