Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csde1Q91W50 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms