Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp3Q91W36 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms