Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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