Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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