Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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