Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colec12Q8K4Q8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms