Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rdh16f2Q8K3M1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rdh16f2Q8K3M1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rdh16f2Q8K3M1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rdh16f2Q8K3M1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rdh16f2Q8K3M1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rdh16f2Q8K3M1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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