Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OptnQ8K3K8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms