Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms