Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd3Q8K2F0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms