Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c1Q8K284 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms