Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8K039 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8K039 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8K039 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8K039 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8K039 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8K039 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8K039 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8K039 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8K039 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8K039 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8K039 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8K039 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8K039 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms