Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CopaQ8CIE6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms