Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms