Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcerg1Q8CGF7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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