Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc43a2Q8CGA3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms