Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc9Q8CDN9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc9Q8CDN9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms