Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufl1Q8CCJ3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms