Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc159Q8C963 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms