Protein–RNA interactions for Protein: Q8C460

Eri3, ERI1 exoribonuclease 3, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri3Q8C460 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms