Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska3Q8C263 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska3Q8C263 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska3Q8C263 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska3Q8C263 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ska3Q8C263 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska3Q8C263 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms