Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms