Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp38Q8BW70 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms