Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab3gap2Q8BMG7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms