Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms