Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem260Q8BMD6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms