Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rspo4Q8BJ73 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rspo4Q8BJ73 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms