Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdca8Q8BHX3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms