Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NanogQ80Z64 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms