Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms