Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm5bQ80Y84 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm5bQ80Y84 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms