Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zbed4Q80WQ9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Zbed4Q80WQ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Zbed4Q80WQ9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Zbed4Q80WQ9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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