Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2eQ80UW8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2eQ80UW8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms