Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Mycbp2Q7TPH6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms