Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms