Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms